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一、考试的总体要求
熟悉、掌握生物信息学的基本概念、基本原理、基本研究方法、主要研究内容以及常用的核酸和蛋白质数据库等；掌握基于互联网的常用生物信息学软件的基本操作使用方法；充分了解生物信息学的主要发展趋势和前沿领域。
二、考试的内容及比例（重点部分）
1.生物信息学概论、常用核酸与蛋白质数据库 （10%）
生物信息学的定义、基本概念及其发展现状；生物信息学研究的基本内容、基本原理与生物学基础。常用核酸、蛋白质序列数据库；数据库检索；应用举例。
2.序列对比与相似搜索原理、序列特征分析（20%）
序列同源搜索的生物学原理及概念；常用软件，例如 BLAST 等算法原理；BLAST 衍生系列软件的使用及应用举例。DNA、蛋白质序列特征的分析；相关常用软件及其基本原理；应用举例。
3. 基因注释与功能分析（20%）
基因注释与功能分析的目标与内容；基于同源信息的基因结构注释方法；基于统计建模的基因结构预测方法；基因组结构注释相关工具与资源；Gene Ontology 的相关平台及常用工具；KEGG 的相关平台及常用工具。
4. 蛋白质特征分析与功能预测（20%）
蛋白质序列与结构简介；蛋白质序列特征分析方法、相关工具与资源；蛋白质结构数据的获取、显示与分析；蛋白质结构预测的相关工具与资源；基于结构的蛋白质功能预测。
5. 分子进化分析与构建系统发生树（20%）
核苷酸和蛋白质分子进化及系统发生树的基本概念与方法；进化模型与进化距离计算的基本原理；构建系统发生树的相关软件与资源的使用。
6. 生物信息学前沿技术（10%）
了解生物信息学领域中的前沿方向与计划，如 ENCODE 等；了解系统生物学与合成生物学等领域的发展；了解各类组学研究中的常用方法。
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